KILLING FLOOR 2 transporte le joueur en Europe continentale, environ un mois après les épreuves décrites dans le KILLING FLOOR original. L'épidémie provoquée par l'expérience ratée d'Horzine Biotech s'est irrémédiablement développée, paralysant complètement l'Union Européenne : gouvernements, communications et forces militaires sont totalement désorganisés, et c'est un groupe de civils qui décide de continuer le combat, en établissant des bases financées sur des fonds propres partout en Europe.