Avec Faster, Baby! Lincoln Clay faisait battre la terre de la paroisse de Sinclair dans des poursuites survoltées et des cascades époustouflantes. Dans La hache de guerre il partait à l'aventure en coopération avec John Donovan. Dans Le signe des temps Lincoln est face à des membres d’un culte dérangé et violent baptisé les Ensanglantés, qui est connu pour restaurer la justice et l'ordre à New Bordeaux à travers des rituels violents. Le culte utilise un médicament hallucinogène pour plier ses membres à leur volonté, déformant leur perception de la réalité et les transformant en tueurs. Lorsque Lincoln découvre que les Ensanglantés ont utilisé le bar de Sammy pour leurs rituels et qu’il trouve un seul survivant suite à une cérémonie brutale, il promet de protéger New Bordeaux de cette menace mystérieuse. Le signe des temps vous attire dans un jeu du chat et de la souris aux airs de thriller psychologique des années 60 et poussera l’emprise de Lincoln sur la réalité à bout.

Pour infiltrer les Ensanglantés, Lincoln fera appel à ses hommes de main pour démêler le mystère du culte avec de nouvelles armes et tactiques, comprenant le fait de pouvoir lancer des couteaux et la capacité de ralentir le temps lors des phases de combat.

De plus, pour protéger New Bordeaux de la nouvelle menace mystérieuse, dans Le signe des temps, les joueurs auront également l’opportunité de restaurer le bar de Sammy et symboliquement achever la quête de rédemption de Lincoln.